Riadiaci orgán OP KaHR využíva sieť existujúcich implementačných agentúr ako sprostredkovateľských orgánov pod Riadiacim orgánom (ďalej len „SO/RO“), ktoré sú v pôsobnosti MH SR a svojim vecným zameraním nadväzujú na opatrenia operačného programu. Úlohu SO/RO plnia nasledovné agentúry: